重庆当局一开始就把矛头对准法轮功学员。据了解，童家桥派出所所抓的50多人全是法轮功学员。警察把抓来的人动辄毒打，甚至施以酷刑，大搞逼供。在残暴的毒打中，法轮功学员张敬之被打成重伤送进医院治疗。在家属们强烈要求放人和社会的谴责下，大部份被抓人员陆续放回，但至今为止，还有张敬之和文廷玉两位法轮功学员仍被关押迫害。在中共各大媒体的报道中，却未提法轮功一个字。明眼人都说：他们又要黑整法轮功了。

最近时期以来，中共重庆当局又针对“写劝善信”这件事，派出警察上门软硬兼施大量收集法轮功学员笔迹，企图掀起新一轮大迫害。

据明慧网报导，这次打压法轮功的主谋是薄熙来。二零零七年十一月薄熙来被调任重庆市委第一书记以来，大批法轮功学员抓捕入狱，遭受残酷的迫害，仅去年奥运前后被抓被关的法轮功学员就有100多人。到目前为止，已有多名法轮功学员被迫害致死，致残致伤的比比皆是。

江津区法轮功学员江锡清老人，被重庆西山坪劳教所毒打后昏死关入冰尸柜。6个多小时后，当其子女接警方通知前去查看遗体时，竟发现多处还有体温，惊呼“我爸爸还是活的！”强烈要求警方抢救。二十多名事先安排好的在场警察闻声大惊失色，面面相觑，待回过神儿来后，根本就不提抢救二字，而是疯狂的将其在场子女亲戚一一架离现场，迅即将摊放地上的老人又重新投入冰柜，把拯救老人最后的一线希望扼杀了。

江北区法轮功学员亢宏，在重庆西山坪劳教所的残酷迫害中，竟被警察将腿打断，他们既不认真治疗，又不准保外就医，仍继续对他迫害和折磨，使其痛不欲生，以致精神失常，粪便满身，呼天号地，惨不忍睹。

报导最后指出，“中共对法轮功学员的迫害是无所不用其极的。两位法轮功学员张敬之和文廷玉还在恶党的大牢中日夜受着迫害，在牢中多呆一天，他们的身心健康和生命就多一天威胁。”并向重庆和国内外社会界、法律界、党政界和国际人权界紧急呼吁，“希望有正义良知、主持公道的仁人志士、党政官员、社会名流，伸出救援之手，利用各种途径，采用各种方法阻止中共对法轮功学员的迫害，促其马上无条件释放张敬之和文廷玉两位法轮功学员。”

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“污损旗帜案”：2008年11月23日晚，重庆沙坪坝区中共“烈士”陵园红岩魂广场梯道中间的中共党旗、国旗、军旗、团旗、队旗五面血旗被民众投掷上黑色黏稠液体。