但令研究者們困惑的卻是：這顆水晶人頭雕刻得非常逼真。不僅外觀，而且內部結構都與人的顱骨骨骼構造完全相符。而且工藝水平極高，隱藏在基底的棱鏡和眼窩裏用手工琢磨的透鏡片組合在一起，發現眩目的亮光。我們知道，近代光學產生於十七世紀，而人類準確地認識自己的骨骼結構更是十八世紀解剖學興起以後的事。這個水晶頭顱卻是在非常了解人體骨骼構造和光學原理的基礎上雕刻成的，一千多年前的瑪雅人是怎樣掌握這些高深的解剖學和光學知識的呢？

還有，水晶即石英晶體，它的硬度非常高，僅次於鑽石（即金鋼石）和剛玉，用銅、鐵或石制工具，都無法加工它。即使是現代人，要雕琢這樣的水晶製品，也只能使用金鋼石等現代工具。

從這個奇異的水晶頭顱來看，也許瑪雅人掌握的科學技術，比我們所想象的還要高超得多。但他們又是怎樣獲得這些科學技術的呢？這就更是謎中之謎了。