1901年12月23日，林巧稚出生在福建省思明县鼓浪屿的一个教员家庭。5岁时，母亲去世。1914年，她加入基督教会，成为了一名虔诚的基督徒。1921年，毕业于厦门女子师范学校，之后考入北京协和医学堂。八年后，林巧稚毕业并获得医学博士学位，被聘为协和医院妇产科大夫，成为该院第一位毕业留院的中国女医生。

1939年，林巧稚前往美国芝加哥医学院进修；1940年，她被美国方面聘请为“自然科学荣誉委员会委员”，同年回国，成为协和医院第一位中国籍女主任。后协和医院因太平洋战争关门，林巧稚就开办了私人诊所。1948年，协和医院重新开门，她返回工作直至去世。

对于这样一位医学界颇为出名的人物，中共自然千方百计拉拢。1949年中共夺取政权后，定于10月1日在天安门召开政府成立大会，有关部门遂于九月中旬向林巧稚发出金字请帖，邀请其登天安门观礼。在常人看来，这是一个难得的、无上荣耀的机会，但是信奉基督的林巧稚却找来协和中共支部书记说道：“天安门开大会和妇产科有什么牵连，我谢绝参加！”

1950年，中共在全国掀开了“土地改革”运动，卫生部通知林巧稚去四川参加土改，她又找来支部书记说道：“我作为一个信仰《圣经》敬畏上帝的基督徒，自我大学毕业的那一天起，我就立定心志，终生不参加任何与医学妇产科学无关系的组织或活动。乡村土改和妇产科有什么关系？我拒绝参加！”

五十年代初的一天，一辆轿车来协和接林巧治去中南海见周恩来。见面寒暄几句之后，毛泽东突然出现了，也说了两句客气话。周恩来直言说道：“共产党建设‘新中国’需要各方面的人才来领导，如果林教授愿意参加共产党，我和毛主席愿意当你的介绍人，这个问题可能很突然，林教授可以回去考虑几天再答复。”林巧稚当即站起来微笑着表示感谢，“但我不能不直言相告，不用回去考虑几天现在就做出正式的答复吧！我是一个信仰《圣经》敬畏上帝的基督徒，共产党是无神论者的政党，我是绝对不能参加的。……我青年时期就在上帝面前立志除了医学有关团体以外，任何政治团体或组织绝对不参加。”听了林巧稚的回答，毛和周都没有再说什么，派车将她送回了协和。

在以后历次中共发生的运动中，林巧稚虽没有遭受大的磨难，但日子也并不安生，她被迫参加各种各样的活动。然而，她那颗与人为善之心却从没有变过，当文革期间，多数协和教授都停发工资被关进牛棚劳动改造时，她常常把自己的工资分成许多份儿，悄悄送到各家去。

1981年，在80岁生日前夕，林巧稚接受了《中国青年报》记者的采访。她告诉记者：“我是一名医生，经历了太多的生死。我不怕死，《圣经》上说：‘我必往他那里（耶稣那里）去’。”

1983年4月22日，林巧稚医生走完了她的一生。也许，此时不必直面人生悲苦的她，正满怀着喜悦沐浴在神的普照中。