据中国青年报26日报导，国家大剧院正面临比硬件更棘手的问题。全国政协常委，中国文联副主席、国家大剧院艺术委员会主任的吴祖强，在去年两会上提交的提案， 为国家大剧院亟需解决的一系列问题呼吁，得到了很多政协委员的联合签名。但国家大剧院一整套运作机构的建立，目前尚未排上日程表。他说，“我认为，国家大剧院要 和国际演出界接轨，软件和硬件的建设必须同步，甚至从某种意义上说，可能软件建设的重要性和难度都要高于硬件建设。”
“其实，我们也非常著急！”吴祖强说。国家大剧院一旦启用，就得有人管，如此庞大的专业场所，方方面面都需要有序的操作，“但是，眼下真有点来不及了”。
* 国家大剧院面临三大困扰
报导透露，国家大剧院艺术委员会办公室主任、国家大剧院演出经营部部长周志强，在接受中国青年报记者采访时坦陈了他们眼下的三大困扰：
1， 国家大剧院谁来主管？ 由文化部，还是北京市政府，还是其他部门单位主管？不清楚！因此，一系列运作不能经由正常程序准备。譬如，演出立不了项。
2， 国家大剧院门为谁开？ 国家大剧院究竟是企业还是事业单位？进入大剧院演出的，算公益演出还是商业演出？都不确定。另外巨额的运作成本，很难实现面向广大文化消费者。
3， 谁能到国家大剧院演出？周志强透露，他自己曾经提出两个“非一流”原则，即：非国际一流团体不能进入大剧院演出，非一流国内团体不能参加大剧院演出。“但谁来认证、界定这个所谓的‘一流’？”
按照计划，今年底，国家大剧院将完成建筑安装工程。2005年1月，转入设备调试和试验性演出阶段。2005年9月，第一个演出季开始启动。
77岁的吴祖强表示，“今年，我和一些志同道合的两会代表，还是要将有关国家大剧院的软件建设问题力争到底”。
国家大剧院被中国媒体称为中国文化史上的一个里程碑，但是在即将落成之际却还没有确定一整套运作机制，使耗资超过26亿元的巨大工程可能面临“空城计”的尴尬，难怪有网友指责这是一种巨大的浪费。
剧院评委会副主席加拿大建筑大师艾瑞克逊在谈到这个方案时用了”shroud”（尸衣）这个词，意指它太像坟墓。
* 备受争议的国家大剧院
法国建筑师安德鲁对国家大剧院的“蛋形”设计方案曾招致众多的反对声浪，大剧院评委香港建筑师潘祖尧说，“大笨蛋”对中国民族传统和地方特色大唱反调，对天安门地区只有破坏，没有建设。大剧院评委会副主席加拿大建筑大师艾瑞克逊在谈到这个方案时用了”shroud”（尸衣）这个词，意指它太像坟墓。2000年6月，多名中国科学院、中国工程院「两院」院士牵头、近百专家学者联署上书中央有关部门质疑该工程。
为什么招致众多知识分子反对的 “蛋形”设计能从众多的优秀设计方案中‘脱颖而出呢’？吕加平在《向中央领导反映一些有关江泽民的事情和传闻》中说：“现在社会上广泛传说，在人民大会堂西侧花费三十多亿人民币修建的像坟包一样的国家大剧院，是江泽民为宋祖英演出修建的。”
他还说，“据报导，朱佩在担任法国总理期间曾违反和破坏中法关系，私下向台湾当局出售攻击型潜艇，赚取巨资，后来此事被台湾军方 的人泄露而发生杀人灭口事件，引起舆论大哗。据说法国政府为平息事态和缓和中法关系，在给台当局十数亿美元资金回扣以掩口外，也给了中国方面数亿美元的回 扣以图摆平免斥。中国方面对此事应向法国提出抗议，即使收受此巨款，也应用于海军建设。可是当时担任中国党政军一把手的江泽民既没有抗议，而且在收了此巨 款后也没有用于海军建设，而是把它为宋祖英演出盖了国家大剧院。并且不顾国内权威建筑设计专家和清华大学等著名院校和设计部门的强烈反对，排斥一切国内优 秀设计方案，一定要采用并未通过评审的法国人的坟式设计，以讨好法国人，并让此钱还由法国人赚去。”
江泽民为宋祖英在澳大利亚和奥地利演出使其扬名世界，不惜动用数千万人民币海军军费。