据中央电视台报道，中国南海海域渔业捕捞能力大大超过了资源的再生力。海洋的底部原本是凹凸不平的，但是由于捕捞船的拖网在海底长期拖拉，许多礁石都遭到破坏。没有了礁体，海洋微生物无法生存，海底生态环境因此出现荒漠化的趋势。另外，大量没有经过处理的废水直接排入大海，造成海水水质不断恶化，赤潮频繁发生。
珠江口海域本来有200多种海洋鱼类繁衍生长，现在鱼类品种已经减少到50余种，国家一级重点保护动物中华白海豚在珠江口只剩下400头左右。环境的恶化也使得渔业资源出现衰退现象，渔业资源的平均密度只有80年代的八分之一，著名的万山、甲子等六大渔汛已基本消失，一些海域甚至出现无鱼可捕的情况。