廣州上海密設分局
臺灣電子報《東森新聞報》報道，由大陸國安部所直屬的訓練局是由國際關係學院、國際政治學院、現代國際關係研究所等三個「學術機構」組成，這三機構每年均參與北京地區一般大學的招生活動，定期發行《現代國際關係》雜誌。
由於國際關係學院以及國際政治學院對於來自臺灣的報考學生自有其一套內部評分標準，因此是否也藉此同時「甄選」情報員，則無法證實。
至於大陸國安部的「臺灣局」，主要工作是處理臺灣內部大小事務的資訊。每天上午十時，臺灣局便會將臺灣各大小媒體報道的政治、經濟、軍事、民生、社會動態等消息，彙編成冊，立即研判有關政治、軍事及經濟三大類資訊，作爲每天下午三時三十分由國安部總部舉行的內部信息報告的主要內容。
解放軍總政治部所屬的「聯絡部」，則是獨立的反情報組織，原名「敵工部」。除了已得知的四個分支單位外，聯絡部在廣州及上海也祕密地設有分局，其工作專門針對臺灣的軍隊事務。
上校軍官詳列資料
據報道，在上海的聯絡部分局是專門研究臺灣軍隊事務的專業單位。它對臺灣上校級以上軍官均列有極詳細的電腦資料，其中除了最基本的出生日期、籍貫、學經歷之外，對於個人的一般生活狀況、居住現址，甚至是所能獲得的私生活狀況，均是該分局要處理的工作，而且每隔十五天便進行一次系統校正。
總政治部對臺灣除了暗地採用諜報技術之外，多數對外活動是以「中國人民對外友好聯絡協會福建省分會」作爲正常的交流渠道，並會同南京軍區所屬的「亞太研究中心」等學術機構，共同對臺進行情報工作，而部分工作經費是來自總政治部所經營的「凱利公司」提供。
《東森新聞報》引述臺灣國防部總政戰部官員稱，大陸一般蒐集軍事情報的種類約可分爲兩類，一是以硬體的軍備事務爲主，另一則以軟性的軍隊士氣、各級指揮官領導風格等爲主。「挖根」工作其實就是針對特定人士的私生活或其家屬的違法犯紀等前科，以非正當渠道刻意向相關高層透露，迫使該員必須另調他職或查辦等.