據明報報導，董建華的言論引起民主派議員何俊仁的嚴厲批評，指董建華雖強調政府暫時無意立法，但卻把法輪功定性爲邪教，是否「表達一種長官的意志，一種人的權威指令更高於法律」，或是他跟從中央的指示。
何俊仁還指出，董建華單憑一些中共提供的影片或資料就達成這個結論，將之定性爲邪教，「你也了解你今天的身分和地位，你說話的分量是非常重的，你今天這樣把一個組織定性，明天你也可以定性另一個組織」。
何俊仁更嚴詞批評特首「你對人家的傷害是很大的，其實這是非常嚴重的誹謗，如果你沒有足夠的證據支持你的話」。
另據臺北報導，陳水扁14日接見民進黨立委時表示，他已經交代有關安全部門，如果中國法輪功創始人有意申請來臺，「就讓他進來」，陳水扁說，如果不讓他進來就跟中共沒什麼差別了。
陳水扁14日接見民進黨立委，與會的立委共有9人，分別是：黃爾璇、張清芳、楊秋興、賴清德、蔡同榮、李俊毅、鄭朝明、周清玉及張學舜。
在談到人權問題時，與會者轉述指出，陳水扁表示，他已經交代有關安全部門，如果中國法輪功創始人有意申請來臺，「就讓他進來」，雖然有關安全部門對於這件事有頗多擔憂，但陳水扁說，如果中共不準的事，臺灣也不準，那就跟中共沒什麼兩樣，因此他要求有關安全部門必須同意這件事。
香港的「一國兩制」早已是名存實亡，臺灣卻在北京武力攻臺的殺聲中保持着自己的清醒頭腦，董特首面露猙獰而陳水扁不與狼同舞。香港上月的雞流感，港府被迫銷燬全港一百二十萬只禽鳥，港府動員千人一日殺雞138000只令目前約五萬名從事農場、飼料商、批發商、零售商及家禽運輸從業員失業，估計連同從業人員的家庭成員，將會令受影響總人數達二十萬人。近日又發生六起霍亂，病人均無離港旅遊史，這如何解釋呢？
由於董特首和陳水扁對待法輪功的問題持完全相反的態度，有人預言：如若董特首繼續緊跟北京，香港會災難連連，而臺灣則會化險爲夷。