前年三月，原本已屆退休年齡的陳太接受中央政府挽留，延任至今年六月三十日，承諾輔助董特首完成首屆任期，但在今年一月十二日，她卻突然宣佈提前退位讓賢，令特區政府驟然陷入迴歸以來最大的政治震盪。到底發生甚麼事情，迫使陳太突然違背諾言決絕地隱退官場呢？社會一直流傳諸多傳言和猜測，但她始終以一貫的「四萬」笑容面對，笑罵由人。
雖說「冰封三尺非一日之寒」，但激發這場對香港社會影響深遠的風波的「導火線」，原來就是去年九月底北京急召陳太上京之行，在這次會面中陳太受盡屈辱，實際上是北京強迫陳太提前隱退。
去年九月二十二日，特區政府突然收到國務院辦公室通知，邀請政務司司長陳方安生火速上京，與國家領導人「討論香港與內地共同關注的問題」，會面時間定於四天之後。
迴歸三年來，陳太曾多次赴京與領導人會面或出席重要會議，從來提前數月已作安排，如此「十萬火急」極爲罕見，傳媒亦感到事非尋常，但連陳太本人都沒有想到，此行原來「荊棘滿途」。
九月二十六日，陳太抵達北京當日下午，立即獲得安排到中南海紫光閣與副總理錢XX見面，但在約一個半小時會面中，錢XX只是客氣寒暄和詢問若干香港最新發展情況，並無特別訓示，隨後將「具體詳談」的任務交給港澳辦主任廖X。
不過，官方的新華社在錢陳會面結束僅半小時後，罕見地立即向外發佈新聞，強調錢XX希望陳太「更好地支持特首工作」。
但與此同時，當陳太移師港澳辦大樓與廖X繼續詳談時，廖X立即收起先前的和顏悅色，板起臉孔猛烈批評陳太未能與特首董特首好好合作。
據港澳辦事後向中央及北京各涉港事務機關發出的一份正式「內部通報」透露，廖X當時的「訓示」簡短，但語氣卻很重，據了解，有人當面對陳方安生髮出一個訊息：「你不要以爲不支持特首，你便可以當特首，就算你選上，我們（中央）也不會批准！」
隨後，港澳辦一名處長級官員充當「主角」與陳太單獨對話，而該名處長當面滔滔不絕力數陳太不支持特首的種種「罪狀」，陳太當場氣得臉色鐵青，會面不歡而散。港澳辦事後的「內部通報」，形容中方在此次會面中「好好『修理』（教訓）了陳方安生一頓」；而陳太事後亦曾向友人承認，她當時亦十分生氣，且擺出強硬態度回敬：「如果你期望我坐在那甚麼也不說，我做不到，這不是我的個性。」
一名資深的中方官員指出，從種種象可以顯示，北京去年九月急召陳方安生火速上京的安排，完全是爲了向她顯示顏色表達強烈不滿，特別是北京刻意安排一名級別低得多的官員向陳太「開火」，這已不是「冷待」，而是刻意的「羞辱」！
而港澳辦作爲中央與特區之間的聯絡機構，敢於作出如此「干預特區事務」的大膽舉動，而且事後還向中央各涉港事務機關發出內部通報，非常明顯是在對港澳「關懷倍至」的國家主席的授意下而爲的。
也正因爲如此，國家主席後來在十月初會見上京述職的董特首時，被記者質疑北京高層有意「欽點」特區第二屆特首，隨即老羞成怒，大發雷霆，大罵香港記者「太簡單、幼稚」，鬧了個千古絕笑。