最先接到確定的劫機跡象的該屬當天早上八時十四分從波士頓起飛，準備飛往洛杉磯的聯合航空公司第一七五次班機。該客機剛起飛，塔臺就要求其他駕駛員協助尋找已經失蹤的第十一次班機。
第一七五次班機駕駛員在八時四十一分，即起飛後不久報告稱：「我們剛離開波士頓就聽到可疑的聲音。彷佛有人對著麥克風說，大家都坐在自己的座位上。」
可惜不到九十秒鐘，第一七五次班機也成了製造大禍的另一項工具。第一七五次班機偏離飛向洛杉磯的航道，並停止與地面通訊。
八時五十分，一個不知名的駕駛員透過公共頻道說：「有沒有人知道下曼哈坦的濃煙是怎麼回事？」
原來在幾分鐘前第十一次班機已撞毀世貿中心雙子星大樓的北座大樓。塔臺再三呼尋第一七五次班機，但一直沒有迴音，情狀沉寂得十分可怕。
八時五十三分，第一七五次班機以大約八百公里的時速—是合法時速的兩倍有餘—朝南邊飛越哈德遜谷，看在長島塔臺人員眼裏，一切真相至此大白。他說：「可能是劫機，我們現在有點問題。」
可惜他看到的真相還只是一半。
在第十一次班機撞進北座大樓之後幾分鐘，印第安納波里的塔臺人員企圖聯絡從華盛頓郊外的杜勒斯國際機場飛往洛杉磯的美利堅航空第七十七次班機。駕駛員曾確認接受到指示，飛向肯塔基州法茅斯，但隨後即未再回應地面的通話。
八時五十六分，第七十七次班機顯然已經失蹤。聯邦航空管理局早已和五角大廈聯絡，談到從波士頓起飛的幾架班機可能已遭劫持。二十八分鐘後，即九時二十四分，聯邦航空管理局通知北美防空指揮部美利堅航空公司第七十七次班機失蹤的消息。戰鬥機立即升空。
九時零九分，未經證實的報導稱，又一架客機撞進世貿中心南座大樓爆炸，當時大家都以爲這架客機可能就是美利堅航空第七十七次班機。事實上，美利堅航空第七十七次班機正回頭飛越匹茲堡，朝華盛頓飛去。
九時三十三分，杜勒斯機場塔臺發現雷達上有不明黑點，立即通知雷根國家機場塔臺說，有一架飛機朝東方飛行，飛向白宮、國會大廈和華盛頓紀念碑所在地的禁航區。
杜勒斯機場監控人員透過熱線通知白宮特勤單位。當時布希總統正在佛羅里達州，特勤人員火速將副總統錢尼護送到地下碉堡。
九時三十八分，這架飛機撞進五角大廈西側。
紐約時報華盛頓十五日電/聯合報編譯